报告人：张瀚教授，南开大学人工智能学院

报告题目：scPROTEIN-用于单细胞蛋白质组学嵌入的多功能深度图对比学习框架

报告时间：2024年4月25日14:00-15:00

报告地点：数学学院216

报告摘要：

单细胞蛋白组数据独特的复杂性使得蛋白组数据的分析处理成为一个严峻的挑战。scPROTEIN是专为单细胞蛋白组数据分析设计的深度学习框架，旨在解决蛋白质定量数据的不确定性、数据缺失、批处理效应以及高噪声等一系列在处理中相互交织的复杂问题。scPROTEIN基于图对比学习进行单细胞蛋白质组学表征学习，设计了统一的深度学习框架学习到准确的细胞嵌入表示，可用于一系列下游分析。这一框架不仅能够提高单细胞蛋白组数据的分析精度，还能够推动临床蛋白组数据的应用研究，为解析复杂的生物学问题提供了新的方法与工具。

文章链接：https://www.nature.com/articles/s41592-024-02214-9

报告人简介：

张瀚，南开大学人工智能学院智能工程系主任，教授，博士生导师。研究方向为图学习、组学数据处理与分析、医学影像处理等，获2022年天津市自然科学一等奖（2/3）。近年来以第一作者与通讯作者（含并列）在Nature Methods、PNAS、Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Information Sciences、KBS、ESWA、BIB、IEEE TIM等期刊发表学术论文三十余篇，包括2020年ESI热点论文1篇，单篇最高SCI引用1350次以上；研发了组学数据整合与批次效应处理、异质图学习等系列智能方法和国际广泛使用的蛋白质（碳水化合物活性酶CAZy）功能注释的dbCAN算法工具链，曾担任中国自动化学会青工委常务委员。